Interleukine 28 B
Rationnel: L’IL28B est l’un des 3 gènes de la famille
interféron lambda, impliquée dans l’élimination
de certains virus. Plusieurs études indépendantes ont identifié 2 SNPs en
déséquilibre de liaison dans le promoteur de l’IL28B associés à la réponse antivirale prolongée de la combinaison
peginterféron ribavirine pour le traitement des hépatites C (génotype 1). (Tanaka Nature genetics 2009; Thomas Nature 2009; Suppiah Nature genetics 2009; Ge Nature 2009; Clark Clin Pharmacol Ther 2010).
Identification des SNPs : Les 2 SNPs associés à la réponse antivirale sont les SNP rs12979860 et rs8099917.
Fréquence des polymorphismes: la fréquence allélique "C" (bonne réponse au traitement antiviral) du rs 12979860 est de 0,76 chez les Occidentaux, 0,93 chez les Asiatiques et 0,35 chez les sujets d'origine Africaine. La fréquence allélique "G" (échec au traitement antiviral) du rs8099917 est de 0,18 chez les Occidentaux, 0,06 chez les Asiatiques et 0,03 chez les Africains.
Fonctionalité du polymorphisme chez l’homme: La fonctionnalité n’est pas très claire. Pour le rs 8099917, l’allèle minoritaire est associé à une plus faible expression de l’IL28 chez les sujets sains. Pour le rs 12979860, il semble que ce polymorphisme soit en lui même associé à la capacité de l'organisme d'éliminer ce virus en l'absence de traitement (clairance virale). La différence de fréquence du SNP rs12979860 entre Occidentaux, Africains et Asiatiques explique en bonne partie la réponse antivirale prolongée qui varie selon l’ethnie : Chez les sujets d’origine Asiatique, la réponse prolongée au traitement antiviral HCV génotype 1 est de l’ordre de 75% (FA = 0,93) ; Chez les sujets Occidentaux la réponse prolongée de 50% (FA = 0,76) ; chez les sujets d’origine Africaine, la réponse prolongée est d’environ 25% (FA= 0,35). Parmi les facteurs prédictifs de réponse au traitement le SNP rs12979860 est un meilleur prédicteur que la charge virale initiale, le score METAVIR ou l’ethnie. Dans une analyse tenant compte des autres facteurs prédictifs de réponse à la bithérapie le % de guérison a été de 78% (CC rs12979860), 38% (CT rs12979860) et 26% (TT rs12979860).
Indication du test de génotypage : Réponse à la bithérapie peg interféron-ribavirine pour prévision de la durée de traitement pour une hépatite chronique active au virus C de génotype 1.
Rendu de résultat : Pour le rs12979860, (bonne réponse au traitement antiviral) : le génotype CC est associé à une réponse antivirale prolongée de 80% à un traitement de 24 semaines ; les génotypes TT et CT sont associés à des réponses de l’ordre de 30 à 40 % à 24 semaines, il convient chez les porteurs de l'allèle T de prévoir un traitement de 48 semaines ou de leur proposer une autre combinaison d'antiviraux, sans qu'on sache à l'heure actuelle quoique se soit sur les relations éventuelles entre ce SNP et d'autres stratégies thérapeutiques.